外泌体的定量与表征

Fidabio的主要优势:

•测量外泌体的大小和亲和力

•定量未知样品中外泌体的浓度

•可在培养液中直接检测,仅需微量样品数据可靠

•内置质量控制模块

前言

外泌体是从细胞中释放出的一种胞外囊泡,含有如蛋白质、DNA和RNA等胞内成分,充当着向其他细胞传递某些遗传信息的载体1。外泌体在细胞间的通讯可能发生在正常细胞和异常细胞之间,也可能发生在不同组织的细胞之间。研究表明,外泌体在免疫应答,病毒侵染,妊娠,心血管疾病,神经系统退行性疾病,癌症等进程中均发挥重要作用。因此,外泌体在临床诊断和细胞治疗领域的应用研究方兴未艾1。在本应用报告中,展示了使用FIDA(流动诱导分散分析)技术测定外泌体的大小(流体力学半径,Rh),定量浓度,以及测量其与相关分子间的亲和力。FIDA是一种基于毛细管的技术,在溶液中自然条件下测量生物分子间的结合亲和力和复合物的粒径(流体力学半径,Rh)2,3,4。本研究利用抗CD81抗体和抗外泌体抗体,分别检测外泌体在缓冲液和用过的培养基(细胞培养液)中的结合亲和力,以cholesterol -topfulor作为指示剂(indicator)测量外泌体的大小。

材料与方法

Fida-1仪器,488nm激光诱导荧光检测,Fida标准毛细管(内径:75µm,LT:100cm,Leff:84cm)。样品分析,先用4 µL外泌体溶液充满毛细管,随后注入39 nL抗体,在25°C,pH7.4,50 mbar 压力下随外泌体溶液向检测器移动27分钟。亲和力分析,在固定浓度的抗体和指示剂的条件下(10 nM抗CD81抗体,1000 nM cholesterol-Topfluor抗体和100nM抗exosome抗体),分别用一系列梯度浓度的外泌体分别进行测定。使用专用FIDA软件进行数据分析。

结果

CD81抗体与外泌体结合

FIDA技术可以测量特定结合物(抗CD81抗体)和感兴趣的分析物(外泌体)相互作用时分子大小的绝对值(即流体力学半径,Rh)。游离的抗CD81抗体的Rh测得为5 nm,与通常的一个抗体分子的大小一致。在缓冲液(图1)和使用后的培养基(图2)中用不同梯度浓度的外泌体溶液分别滴定测量,随着外泌体溶液的浓度增加,抗CD81抗体在两种溶液环境下的表观大小都有所增大,抗体和外泌体复合物的大小测定为44.3-51.3 nm。测定的表观KD值,在缓冲液(60.4)和细胞培养液(73.5)中一致性良好,表明本方法能够在培养液等自然条件中直接检测,并有良好的重复性。

图1。A) Anti-CD81的原始数据,作为外泌体浓度的函数。B)作为外泌体浓度函数的Anti-CD81结合曲线,用结合百分比表示。

图2。A) Anti-CD81的原始数据,作为10 %培养液中外泌体浓度的函数。B)相关结合曲线,用结合百分比表示。

结合曲线是量化外泌体相互作用的有效方式,可对外泌体进行全面的功能表征。此外,结合曲线也可用于直接在培养液中对特定分析物如IgG进行定量5

我们在近期的一个实验中,引入了一个快速超滤步骤,让定量范围增加了一个数量级(图3)。作为一个概念验证实验,应用本方法可以在培养的早期阶段,直接在培养液中定量外泌体浓度。

图3。A) Anti-CD81的原始数据,作为有或无经过超滤的10 %培养液中外泌体浓度的函数。B)相关的结合曲线,描述有经超滤的结合百分比。

抗外泌体抗体与外泌体结合

抗外泌体抗体的流体力学半径测定约为5 nm,与预期的抗体大小一致。随着外泌体的浓度逐渐增加,抗体指示剂的大小显示逐渐增大。从原始数据(图4)中可以直接观察到这一点:外泌体浓度的增加导致游离抗PTGFRN(窄峰)减少,同时与外泌体相结合的抗PTGFRN(宽峰)增加。根据图3B中的结合等温线可确定抗外泌体抗体与外泌体之间的表观亲和力(KD)为1E10 p/mL,复合物大小(Y轴流体力学半径)则测定为103 nm。

图4。A)在20 % v/v培养液中,anti-PTGFRN的泰勒图原始数据作为外泌体浓度的函数。B)相关的结合等温线曲线,作为外泌体浓度的函数以流体力学半径表示。

在0-90% v/v培养液中,观察抗外泌体抗体的流体力学半径(大小),评估潜在的样品杂质的干扰。在这里,我们发现抗PTGFRN的表观大小在用不同浓度培养基测量的整个过程中没有显著变化,见下表。

结果表明,抗PTGFRN抗体不与培养液中其他的组分发生相互作用,甚至可在培养基原液中直接检测与外泌体的结合。

表1: 在0-90 % v/v培养液中测得的抗PTGFRN抗体指示剂的大小。

外泌体大小测定

将Cholesterol-topfluor作指示剂,测量外泌体大小。在没有外泌体存在时,Cholesterol-topfulor不溶于水溶液。当添加到外泌体溶液中时,cholesterol-topfluor则可溶解在外泌体的膜上,从而产生信号。该方法也是测定溶液中外泌体大小的通用方法。在这里,我们检测到外泌体的平均流体力学半径为115 nm,该值与用抗外泌体抗体检测时所得的结果完全一致。

图5。1000 nM Cholesterol–topflour在5.8E12p/mL外泌体溶液(20 % v/v培养液)中的原始数据。橙色线是原始数据,蓝色线是计算流体力学半径的数据拟合。

结论

FIDA技术能在培养液等自然条件直接检测外泌体和外泌体-配体复合物的大小和亲和力。此外,该技术在定量未知样品中外泌体浓度具有潜在的应用价值。在近期开发的方法中,我们进一步提高了定量的灵敏度和范围。欲了解更多详情,请和我们联系。